El Programa de Doctorado en Musicología está orientado a la formación de investigadores capaces de desarrollar proyectos originales de investigación y contribuir al avance del conocimiento en el ámbito de la Musicología. A lo largo del doctorado, el estudiantado adquiere competencias para formular problemas de investigación, aplicar metodologías especializadas, analizar críticamente fuentes y repertorios musicales, y comunicar los resultados de su trabajo conforme a los estándares científicos nacionales e internacionales.

La formación investigadora se completa con la participación en congresos, seminarios, publicaciones y proyectos de investigación, favoreciendo la integración del estudiantado en redes académicas y científicas. Las tesis doctorales defendidas en el programa destacan por su calidad científica y, en numerosos casos, obtienen la Mención Internacional, reflejo de la proyección exterior y del compromiso del programa con la excelencia investigadora. Los egresados desarrollan su actividad profesional en universidades, centros de investigación, instituciones culturales, archivos, bibliotecas, museos y otros ámbitos relacionados con la investigación, la gestión y la difusión del patrimonio musical.